A kétezres évek elején még sokkal vadabb volt az operációs rendszerek világa, és ebben a korszakban született meg az egyik legfurcsább Windows-Linux történet is. A Lindows nevű rendszer azt ígérte, hogy egy Debian-alapú Linuxot ad a felhasználóknak, amelyen a Windows-programok is futtathatók lesznek. A név nyilván nem volt véletlen: a Linux és a Windows összeolvasztásából jött létre, és pontosan azt üzente, amit a rendszer megpróbált eladni.
Az ötlet Michael Robertson nevéhez kötődött, aki nem csak hobbiprojektként kezelte a Lindowst. A cél az volt, hogy előre telepített számítógépeken is megjelenjen, és egy ideig ez sikerült is: a Walmart 2004-ig árult Lindows-alapú PC-ket. A terv azonban technikailag sokkal nehezebb volt, mint papíron tűnt. A Windows-alkalmazások futtatását a Wine-ra bízták volna, de ez még ma sem mindig problémamentes, hát még 2001 környékén. A Lindows végül inkább a Click-N-Run nevű szolgáltatásra helyezte a hangsúlyt, amellyel Linuxos alkalmazásokat lehetett egyszerűen telepíteni.
A Microsoft természetesen nem nézte jó szemmel, hogy egy operációs rendszer ennyire hasonló névvel próbál teret nyerni. A cég bíróságra vitte az ügyet, arra hivatkozva, hogy a Lindows név összezavarhatja a vásárlókat, és sérti a Windows védjegyet. A Lindows viszont ügyes ellenérvet választott: azt állította, hogy a "window" kifejezés már jóval a Microsoft operációs rendszere előtt létezett a grafikus felületek világában, vagyis a Windows név egy általános technikai fogalomból ered.
Ez veszélyes helyzetbe hozta a Microsoftot. Ha a bíróság elfogadta volna, hogy a Windows túl általános kifejezés ahhoz, hogy erősen védhető márkanév legyen, az a cég egyik legértékesebb védjegyét gyengíthette volna meg. Az amerikai ügyben John Coughenour bíró nem adott helyt a Microsoft azon kérésének, hogy tiltsák el a Lindowst a név használatától az Egyesült Államokban. Európában a Microsoft jobban állt, de a kockázat így is egyre nagyobb lett.
A vállalat végül nem várta meg, hová fut ki a per. 2004-ben 20 millió dollárt ajánlott a Lindows névért és a hozzá tartozó domainért. A Lindows mögött álló cég elfogadta az ajánlatot, így megtarthatta függetlenségét, de le kellett mondania a névről. A rendszer ezután Linspire néven folytatta, és valamilyen formában ma is létezik, bár már messze nem az a Windows-kompatibilitást ígérő Linux, aminek indult.
A Microsoft ezzel gyakorlatilag megvásárolta és eltemette a számára kellemetlen márkanevet. A Lindows név nem lett belőle új termék, nem tért vissza más formában, egyszerűen eltűnt. A 20 millió dolláros egyezség így nem egy operációs rendszer megszerzéséről szólt, hanem arról, hogy a Microsoft megvédje a Windows márkát egy olyan pertől, amely rosszabb esetben sokkal többe kerülhetett volna neki.
Utólag nézve az egész történet egyszerre abszurd és teljesen érthető. A Microsoft lényegében azért fizetett hatalmas összeget, hogy ne kelljen tovább harcolnia egyetlen betűnyi különbség miatt. De ha a Windows név jogi védelme megingott volna, annak következményei messze túlmutattak volna egy furcsa Linux-disztribúción. A Lindows ma már inkább technikatörténeti lábjegyzet, de egy rövid ideig tényleg komoly fejfájást okozott a világ egyik legnagyobb szoftvercégének.